Заболяването се причинява от B.pertussis. Доказват се три вида Bordetella – pertussis, parapertussis и holmesii. Последните два са свързани със синдром, който клинично наподобява този на магарешка кашлица. Причинителят е микроорганизъм, а не вирус. Засяга лигавицата на трахеята и бронхите. Отделя се със секретите на болния при кашляне. Заболяването е силно контагиозно (заразно). Най-уязвими са неимунизираните и тези с отслабен имунитет за коклюш.
Пробите се взимат в течна Amies среда, с два тампона – от задна фарингеална стена и назофаринкс.
Специални изисквания : гърления секрет – трябва да е сутрин на гладно и жадно или поне 3 часа преди приемане на храна.